灵芝菌种的出产是整个灵芝出产进程中的首要要害，菌种质量的好坏直接关系到灵芝的产量和品质。纯种的出产与制备，其操作技术并不很难，但整个进程中有必要十分留意杂菌及其他微生物的污染，一旦菌种感染杂菌，会影响整批灵芝的培育，往往形成很大的经济损失。因而有必要从各方面对杂菌进行防止与操控，以利于进步灵芝菌种的正品率。
一、灵芝茵种感染杂茵的原因剖析
(一) 拌料时可能发作杂菌污染 如培育料不新鲜、水湿度不妥，或拌料不均匀，都易发作杂菌。
(二) 灭菌不完全引起杂菌污染 如灭菌时刻不行，灭菌温度不行，或灭菌进程中透气不良，均可形成灭菌失利，而感染杂菌。
(三) 接种时没有严厉无菌操作而引起杂菌污染 如接种东西消毒不严，接种进程动作太慢均易引起杂菌感染。
(四) 菌种培育进程中发作杂菌污染 菌种培育时没有留意温度、湿度、光线、氧气等环境要素，而引发杂菌侵染。
(五) 接种用的菌种可能本身带杂而引发污染。
二、灵芝茵种杂菌的操控措施
(一)精心拌料
1．首先应选择新鲜、无霉变、未经雨水淋湿的木屑或棉壳作原材料，且进行合理的配方。
2．灵活把握调水，如果培育料基质偏干，颗粒偏细，酸性强，水分调节应偏，不然就调水少；晴天水分蒸发快，则调水，雨天应调水少；夏天调水，冬季可调水少些。
3．拌料力求均匀，主料与辅料混合均匀，干湿拌和要均匀，ph值均匀。
4．操作力求快速，灵芝制种一般在高温时节，如果拌料时刻过长，培育料易发酸，营养易受到破坏，因而宜尽量快速操作。
5．动作力求轻便，在地上堆积时最好垫一层麻袋，以防擦破菌袋。
(二)严厉进行灭菌
1．常压灭菌时，温度上升力求快速，达100℃时再维持8-10小时。
2．高压灭菌时，凉气要排尽，压力上升到1.5公斤每平方厘米时要坚持2-3小时。
3．灭菌进程中不能随意增加冷水，避免温度俄然下降。
4．灭菌好后，菌瓶(袋)不能立刻出锅，须在锅内闷几个小时再出锅，如能闷上一夜则灭菌效果佳。
 (三)严厉选择菌种
接种用的菌种必定要由专业人员进行仔细的选择，一般要选取皎白、浓密、强健、成长旺盛的菌丝，接种后则成长敏捷，"吃"料快，不易感染杂菌。 (四)严厉接种操作，动作快速
1.接种前，接种室及接种用的一切东西均要进行紧密消毒。
2.接种进程中，不能离开火焰附近的无菌区。
3.接种时先检查棉塞是否打湿，如棉塞湿了有必要及时替换无菌棉塞。
4.接种时动作要敏捷，削减杂菌入侵的时机。
(五)把好菌丝培育关
1．培育室温度坚持在20-25℃左右，湿度为60％-70％左右。
2．留意通风透气。
3．定时清查杂菌，发现被污染的菌种及时处理。
以上几个方面严厉把关，才干有效地操控杂菌污染，制出合格的灵芝菌种。
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